Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GINM1Q9NU53 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GINM1Q9NU53 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GINM1Q9NU53 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms