Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RRP7BPQ9NSQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RRP7BPQ9NSQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
RRP7BPQ9NSQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RRP7BPQ9NSQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RRP7BPQ9NSQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms