Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT84Q9NSB2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms