Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DUOX1Q9NRD9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DUOX1Q9NRD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DUOX1Q9NRD9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms