Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FSCN3Q9NQT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms