Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC3Q9NQT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EXOSC3Q9NQT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms