Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MEPEQ9NQ76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MEPEQ9NQ76 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms