Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PNPLA8Q9NP80 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA8Q9NP80 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms