Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SMURF2Q9HAU4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMURF2Q9HAU4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms