Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
REEP4Q9H6H4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
REEP4Q9H6H4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms