Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEMA6AQ9H2E6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA6AQ9H2E6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA6AQ9H2E6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms