Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTDSP1Q9GZU7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms