Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms