Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF3Q9GZM5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF3Q9GZM5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms