Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM5Q9C035 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM5Q9C035 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM5Q9C035 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms