Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11FIP5Q9BXF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11FIP5Q9BXF6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms