Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLVAPQ9BX97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLVAPQ9BX97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLVAPQ9BX97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms