Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM106CQ9BVX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM106CQ9BVX2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms