Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HERPUD2Q9BSE4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HERPUD2Q9BSE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERPUD2Q9BSE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms