Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP6Q9BRS8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LARP6Q9BRS8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LARP6Q9BRS8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms