Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHCHD6Q9BRQ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHCHD6Q9BRQ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHCHD6Q9BRQ6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms