Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF2Q9BQY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms