Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP3Q9BQQ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP3Q9BQQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP3Q9BQQ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms