Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ24

ZFYVE21, Zinc finger FYVE domain-containing protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE21Q9BQ24 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE21Q9BQ24 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZFYVE21Q9BQ24 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZFYVE21Q9BQ24 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE21Q9BQ24 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE21Q9BQ24 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE21Q9BQ24 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZFYVE21Q9BQ24 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms