Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CITED1Q99966 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CITED1Q99966 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CITED1Q99966 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms