Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRRT1Q99946 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PRRT1Q99946 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PRRT1Q99946 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms