Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD180Q99467 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD180Q99467 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD180Q99467 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD180Q99467 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD180Q99467 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD180Q99467 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD180Q99467 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD180Q99467 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD180Q99467 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD180Q99467 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD180Q99467 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD180Q99467 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD180Q99467 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD180Q99467 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD180Q99467 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD180Q99467 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD180Q99467 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD180Q99467 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD180Q99467 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD180Q99467 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD180Q99467 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD180Q99467 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD180Q99467 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD180Q99467 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD180Q99467 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD180Q99467 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms