Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TSPAN18Q96SJ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN18Q96SJ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSPAN18Q96SJ8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms