Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBGCP5Q96RT8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBGCP5Q96RT8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP5Q96RT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms