Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMTK3Q96Q04 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
LMTK3Q96Q04 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMTK3Q96Q04 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMTK3Q96Q04 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms