Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR78Q96P69 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR78Q96P69 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR78Q96P69 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPR78Q96P69 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPR78Q96P69 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPR78Q96P69 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms