Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIGD1Q96MW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TIGD1Q96MW7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms