Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C12orf66Q96MD2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf66Q96MD2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C12orf66Q96MD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms