Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SUSD3Q96L08 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUSD3Q96L08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD3Q96L08 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD3Q96L08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD3Q96L08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUSD3Q96L08 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms