Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNIP3Q96KP6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNIP3Q96KP6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms