Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PRAC1Q96KF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.2 ms