Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A2Q96JW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A2Q96JW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A2Q96JW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms