Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR1Q96JP9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDHR1Q96JP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms