Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG1Q96JA1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRIG1Q96JA1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms