Protein–RNA interactions for Protein: Q96J01

THOC3, THO complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOC3Q96J01 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THOC3Q96J01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THOC3Q96J01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
THOC3Q96J01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THOC3Q96J01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THOC3Q96J01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THOC3Q96J01 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THOC3Q96J01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THOC3Q96J01 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THOC3Q96J01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THOC3Q96J01 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
THOC3Q96J01 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THOC3Q96J01 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
THOC3Q96J01 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
THOC3Q96J01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
THOC3Q96J01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms