Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUB2Q96DC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUB2Q96DC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.2 ms