Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
OPTNQ96CV9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OPTNQ96CV9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OPTNQ96CV9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms