Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN4Q96CB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NSUN4Q96CB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN4Q96CB9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms