Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB7BQ96AH8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB7BQ96AH8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB7BQ96AH8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms