Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TRIM52Q96A61 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM52Q96A61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM52Q96A61 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms