Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UTP4Q969X6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTP4Q969X6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP4Q969X6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms