Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HGDQ93099 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HGDQ93099 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HGDQ93099 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HGDQ93099 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HGDQ93099 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HGDQ93099 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HGDQ93099 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HGDQ93099 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HGDQ93099 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HGDQ93099 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HGDQ93099 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HGDQ93099 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HGDQ93099 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HGDQ93099 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HGDQ93099 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HGDQ93099 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HGDQ93099 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HGDQ93099 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms