Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLP1Q92989 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLP1Q92989 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLP1Q92989 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms