Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
KRT35Q92764 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT35Q92764 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT35Q92764 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms