Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RABGGTAQ92696 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RABGGTAQ92696 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
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